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CHIP-SEQ服務(wù)
通過(guò)染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)檢測(cè)和測(cè)序技術(shù)相結(jié)合,ChIP測(cè)序(ChIP-Seq)成為鑒定轉(zhuǎn)錄因子及其他蛋白因子在全基因組范圍內(nèi)的DNA結(jié)合位點(diǎn)的強(qiáng)有力方法。
服務(wù)類別:測(cè)序/合成總訪問(wèn):814
最后更新:2019-1-18半年訪問(wèn):31
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ChIP-SEQ
通過(guò)染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)檢測(cè)和測(cè)序技術(shù)相結(jié)合,ChIP測(cè)序(ChIP-Seq)成為鑒定轉(zhuǎn)錄因子及其他蛋白因子在全基因組范圍內(nèi)的DNA結(jié)合位點(diǎn)的強(qiáng)有力方法。在ChIP操作之后,通過(guò)特異抗體將DNA結(jié)合蛋白免疫沉淀。結(jié)合的DNA被同時(shí)沉淀、純化并測(cè)序。新一代測(cè)序(NGS)在ChIP上的應(yīng)用已經(jīng)揭示了一些在各種疾病和生物學(xué)通路(如發(fā)育和癌癥發(fā)展)中發(fā)揮作用的基因調(diào)控事件的線索。ChIP-Seq能夠在全基因組規(guī)模上實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白與核酸相互作用的全面檢測(cè)。
 
  • ChIP-Seq的優(yōu)點(diǎn)
  • 可在任何生物體的整個(gè)基因組中捕獲轉(zhuǎn)錄因子或組蛋白修飾的DNA靶點(diǎn)
  • 確定轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)
  • 結(jié)合RNA測(cè)序和甲基化分析,揭示基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
  • 可兼容不同起始量的DNA樣品
無(wú)偏向性地研究表觀遺傳模式
ChIP-Seq可鑒定DNA結(jié)合蛋白的結(jié)合位點(diǎn),可用于定位一個(gè)給定蛋白的整體結(jié)合位點(diǎn)。芯片及其他研究表觀基因組的方法往往有著內(nèi)在的偏向性,因?yàn)樗鼈冃枰獊?lái)自已知序列的探針,ChIP-Seq則不同,不需要任何先驗(yàn)知識(shí)。ChIP-Seq通過(guò)大規(guī)模并行測(cè)序提供全基因組的圖譜,產(chǎn)生覆蓋多個(gè)樣品的數(shù)百萬(wàn)次計(jì)數(shù)分析,實(shí)現(xiàn)經(jīng)濟(jì)且精確的分析
 
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