small RNA是指長度在18~30nt的內(nèi)源性RNA,包括miRNA,siRNA和piRNA等。它們在mRNA的轉錄及轉錄后水平的調控中發(fā)揮重要作用,參與細胞生長、分化、代謝等各個生物學過程,對生物體的正常發(fā)育和疾病過程起著關鍵作用。Small RNA測序是指基于高通量測序平臺對目標樣本的small RNA進行大規(guī)模檢測,同時發(fā)現(xiàn)新的小RNA,結合生物信息學挖掘手段,研究small RNA的功能、結構和調控機制。
技術路線
樣品要求
²樣本類型:含有samll RNA的total RNA
²樣本總量:>=2 μg
²樣本濃度:>=50 ng/ul
²推薦數(shù)據(jù)量:>=20 M reads/樣本
相關解決方案
癌癥研究:變異檢測

研究人員通常希望能對珍貴的腫瘤樣本進行高度靈敏的分析,以便檢測出低至每個細胞一個拷貝的突變水平。通過小RNA測序,可對miRNA和癌癥轉錄組中存在的覆蓋度極高的其他小型非編碼RNA進行探查和圖譜分析。
復雜疾。篟NA編輯
在先天性和適應性免疫系統(tǒng)、CNS以及多種疾病的細胞中,miRNA擁有獨特的表達圖譜。基于NGS的圖譜可實現(xiàn)快速、高通量的miRNA轉錄組分析,并提供有關RNA編輯過程和突變活動的見解。憑借高覆蓋度功能,小RNA測序可用于探查新miRNA物種或識別罕見變異。