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生物研發(fā)服務(wù)

基因芯片數(shù)據(jù)分析服務(wù)-生物信息學(xué)分析服務(wù)

表達譜分析\家系連鎖分析\GWAS分析\CNV分析

服務(wù)類別：	芯片與生物信息學(xué)	總訪問：	4243
最后更新：	2015-8-19	半年訪問：	71
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服務(wù)商：晶能生物技術(shù)（上海）有限公司

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服務(wù)介紹
公司簡介

1．表達譜分析：通過芯片雜交信號的熒光強弱來得到mRNA，miRNA的表達量或者CpG位點的甲基化程度，利用統(tǒng)計學(xué)方法來篩選差異位點，最后借助功能分析來尋找可能的生物學(xué)解釋。

A：基本分析流程

B：部分結(jié)果展示

Box plot 圖：是利用數(shù)據(jù)中的五個統(tǒng)計量：最小值、第一四分位數(shù)（25%）、中位數(shù)（50%）、第三四分位數(shù)（75%）和最大值來描述數(shù)據(jù)的一種方法，它也可以粗略地看出數(shù)據(jù)是否具有有對稱性，分布的分散程度等信息。

Pca 圖：通過降維度的方式來看樣本間的相似程度，不同的顏色表示不同分組的樣本。樣本間距離越近表示樣本基因的表達趨勢約接近。

火山圖：兩條綠色直線對應(yīng)fold change 2倍差異，綠色橫線對應(yīng)P=0.05，紅色是差異基因區(qū)域。

非監(jiān)督聚類圖：縱列表示樣本橫列表示基因，信號值的強度用色階表示，進化樹表示基因或者樣本的相似程度。

自組織映射聚類SOM 分析：將變化趨勢一致的基因聚類，橫坐標(biāo)是不同階段，每條線表示一個基因的表達趨勢。

Go 關(guān)系圖

Pathway 圖

網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖

2．家系連鎖分析：適用于單基因病研究，連鎖分析通過分析減數(shù)分裂過程中染色體重組的情況，判斷snp位點與疾病位點之間是否連鎖，以及連鎖的緊密程度（lod score）。然后利用陽性區(qū)域推斷單倍型來明確家系中DNA的傳遞關(guān)系，找到交換發(fā)生的位置進一步縮小候選基因的范圍。

A：基本分析流程

B：部分結(jié)果展示

Lod plot 圖：橫坐標(biāo)是染色體位置縱坐標(biāo)是lod score值

單倍型圖：可以從圖中看到病人共享相同的單倍型

3．GWAS分析：針對復(fù)雜疾病研究，通過大樣本量和全基因組的tagSNP基因分型，借助統(tǒng)計學(xué)方法來控制人群分層等干擾因素的影響，進而識別和疾病顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點，找尋潛在的易感基因。

A：基本分析流程

B：部分結(jié)果展示

利用PCA分析人群分層情況剔除異常樣本

Q-Q plot反應(yīng)樣本群的分層情況，越接近1人群分層情況影響越小

Manhattan plot反映統(tǒng)計檢驗后p值在基因組上的分布情況

顯著位點區(qū)域放大圖

LD plot 根據(jù)LD連鎖關(guān)系得到block區(qū)域,將多SNP位點與候選區(qū)域進行關(guān)聯(lián)展示

4．CNV分析：針對疾病研究，通過包含CNV探針的SNP芯片來檢測拷貝數(shù)變異，利用統(tǒng)計學(xué)方法來優(yōu)化變異區(qū)域的邊界，進而識別和研究關(guān)聯(lián)的CNV區(qū)域，找尋潛在的易感基因。

A：基本分析流程

B：部分結(jié)果展示

CNV區(qū)域的識別

CNV區(qū)域的染色體分布

CNVR區(qū)域的合并

疾病相關(guān)的CNV區(qū)域

晶能生物技術(shù)（上海）有限公司（簡稱“晶能生物”）成立于2010年2月。自成立以來，高速發(fā)展，成為中國生物技術(shù)服務(wù)行業(yè)領(lǐng)先地位的公司。

晶能生物專注健康醫(yī)療產(chǎn)品和生命科學(xué)領(lǐng)域科技服務(wù)，抓住了中國健康醫(yī)療產(chǎn)業(yè)的巨大機遇和生命科學(xué)市場的快速成長勢頭，形成了以產(chǎn)品研發(fā)和科技服務(wù)為核心，涉足生命科學(xué)，臨床疾病、人類健康等領(lǐng)域的產(chǎn)業(yè)化服務(wù)體系，在產(chǎn)品研發(fā)、人才建設(shè)、市場營銷、銷售渠道、專業(yè)服務(wù)等方面形成極具競爭優(yōu)勢的中國知名的高新技術(shù)企業(yè)。

晶能生物注重產(chǎn)品開發(fā)，成立創(chuàng)新健康醫(yī)療研究中心，資深的專家團隊、國際先進的儀器設(shè)備，完善的管理和研發(fā)體系，讓中心成為一個充滿激情、力量雄厚、極具發(fā)展?jié)摿Φ难邪l(fā)機構(gòu)。

晶能生物通過ISO9001:2008質(zhì)量體系認(rèn)證, 并率先成為illumine CsPro和BioNano官方認(rèn)證服務(wù)商。主要技術(shù)平臺有BioNano單分子光學(xué)圖譜平臺、Illumina-Hiseq3000高通量測序平臺、Illumina-Hiseq2500高通量測序平臺、Illumina-Hiseq1500高通量測序平臺、Illumina-Miseq高通量測序平臺，Illumina-iScan基因芯片平臺、Illumina-ECO Real Time PCR平臺、Sequenome-質(zhì)譜分析平臺、曙光高性能服務(wù)器平臺以及各種配套設(shè)備，完成項目達到近2000個，完成專利達到近10項，合作客戶發(fā)表文章影響因子超過400。晶能生物已取得國內(nèi)二代測序，基因芯片等市場的競爭優(yōu)勢，成為這個行業(yè)的領(lǐng)先者。

晶能生物奉行客戶第一、共享快樂、共同成長、持續(xù)發(fā)展的原則，始終懷著感恩的心態(tài)，努力做一個讓社會、客戶、員工和股東滿意的企業(yè)，并成為提供健康醫(yī)療產(chǎn)品和科技服務(wù)的領(lǐng)導(dǎo)性公司。

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