實(shí)驗(yàn)原理
當(dāng)細(xì)胞在非變性條件下被裂解時(shí),完整細(xì)胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用被保留了下來(lái),假如細(xì)胞內(nèi)存在XY蛋白復(fù)合物,用X(X也稱為誘餌蛋白)的抗體免疫沉淀X,那么與X在體內(nèi)結(jié)合的蛋白質(zhì)Y(Y也稱為靶蛋白)也被沉淀下來(lái)。因此在細(xì)胞裂解液中加入X的抗體沉淀蛋白X,隨后利用蛋白印跡(western blot,WB)檢測(cè)沉淀中是否存在蛋白Y,如果存在,則說(shuō)明細(xì)胞內(nèi)存在XY蛋白復(fù)合物,即蛋白XY存在相互作用。
收集蛋白樣品蛋白樣品通常通過(guò)裂解細(xì)胞得到。Co-IP實(shí)驗(yàn)通常有兩種,一種為內(nèi)源性蛋白相互作用驗(yàn)證,另外一種為非內(nèi)源性蛋白相互作用驗(yàn)證,內(nèi)源性相互作用是指兩蛋白相互作用在細(xì)胞內(nèi)發(fā)生,即通過(guò)質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染的方式將兩種蛋白轉(zhuǎn)染至同一細(xì)胞內(nèi)表達(dá),表達(dá)完成后收集細(xì)胞進(jìn)行裂解得到蛋白樣品。非內(nèi)源性相互作用兩蛋白相互作用在細(xì)胞外發(fā)生,即將含有靶蛋白的動(dòng)植物組織、器官進(jìn)行預(yù)處理及細(xì)胞裂解獲得細(xì)胞裂解液,隨后將誘餌蛋白(通常為重組表達(dá)純化獲得)加入細(xì)胞裂解液中,得到蛋白樣品。
沉淀誘餌蛋白利用磁珠偶聯(lián)抗體沉淀誘餌蛋白:在樣品中加入磁珠偶聯(lián)抗體,抗體會(huì)與誘餌蛋白結(jié)合,利用磁鐵將磁珠拉下,同時(shí)誘餌蛋白會(huì)一起被沉淀出來(lái)。如果存在與誘餌蛋白的相互作用的靶蛋白,也會(huì)被沉淀下來(lái)。如果沒(méi)有誘餌蛋白的特異性抗體,可以給誘餌蛋白加上標(biāo)簽(Myc、HA、Flag等),然后利用標(biāo)簽抗體沉淀蛋白。
SDS-PAGE及WB檢測(cè)得到沉淀后,需要驗(yàn)證沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE將蛋白復(fù)合物分離,隨后利用WB檢測(cè)是否存在靶蛋白(如果靶蛋白的分子量是已知的,可以直接用SDS-PAGE檢測(cè)是否存在靶蛋白)。
上述所有實(shí)驗(yàn)所得結(jié)果皆為真實(shí)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,實(shí)驗(yàn)周期短,效率高,服務(wù)質(zhì)量高,感興趣聯(lián)系15511958250 賈先生。
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