Clip染色質(zhì)免疫沉淀（CLIP測(cè)序）

主要原理是基于RNA與其相應(yīng)的RNA結(jié)合蛋白會(huì)在紫外照射下會(huì)發(fā)生共價(jià)結(jié)合，以RNA結(jié)合蛋白的特異性抗體將RNA-蛋白復(fù)合物沉淀之后，回收其中的RNA片段，進(jìn)行qRT-PCR檢測(cè)或測(cè)序分析。最近，這項(xiàng)技術(shù)也被應(yīng)用于microRNA的靶標(biāo)鑒定。
服務(wù)優(yōu)勢(shì)
1經(jīng)紫外照射，細(xì)胞內(nèi)的RNA與相應(yīng)的RNA結(jié)合蛋白交聯(lián)，增強(qiáng)RNA與蛋白的結(jié)合能力
2可檢測(cè)多種RNA，如LncRNA、mRNA、microRNA。
3可通過(guò)mRNA的差異表達(dá)，檢測(cè)microRNA的靶標(biāo)mRNA。
4 PAR-Clip可精確定位RNA與蛋白的結(jié)合位點(diǎn)。
 
服務(wù)內(nèi)容
研究RNA與RNA結(jié)合蛋白的相互作用
研究microRNA的靶標(biāo)mRNA
 
服務(wù)流程
1狀態(tài)良好的細(xì)胞在356nm的紫外燈下照射一定時(shí)間
2收集細(xì)胞，制成蛋白提取液
3磁珠與抗體孵育
4帶有抗體的磁珠與蛋白提取液孵育
5清洗磁珠，加Trizol提取RNA，進(jìn)行qRT-PCR或測(cè)序分析
Clip與RIP的區(qū)別
Clip與RIP的共同點(diǎn)：都是用于研究RNA與RNA結(jié)合蛋白互作的實(shí)驗(yàn)方法
Clip的優(yōu)勢(shì)：Clip與RIP的實(shí)驗(yàn)方法基本一致，Clip在細(xì)胞裂解前要經(jīng)過(guò)紫外的照射�；罴�(xì)胞經(jīng)紫外照射后，RNA與RNA結(jié)合蛋白會(huì)發(fā)生共價(jià)結(jié)合，結(jié)合能力強(qiáng)。而RIP細(xì)胞中的RNA與RNA結(jié)合蛋白通過(guò)氫鍵和范德華力結(jié)合，結(jié)合能力較弱。因此，RIP實(shí)驗(yàn)的洗脫過(guò)程中，會(huì)損失大量的RNA，而Clip實(shí)驗(yàn)有效的避免了這一點(diǎn)。
 
客戶提供
IP級(jí)別的蛋白抗體
所研究的細(xì)胞株
如期提供
qPCR原始數(shù)據(jù)及處理結(jié)果，測(cè)序分析原始數(shù)據(jù)及處理結(jié)果