DNA甲基化芯片

概念和原理

    DNA甲基化是表觀遺傳學(xué)的重要調(diào)控方式，在維持正常細(xì)胞功能、遺傳印記、胚胎發(fā)育以及人類腫瘤發(fā)生中起到重要作用。

    基因組DNA起聲打斷后，用重亞硫酸鹽處理，全基因組擴(kuò)增和酶切片斷化后，與芯片上的等位基因特異性引物退火、雜交，用高解析度芯片掃描儀檢測(cè)雜交信號(hào)。

科研和臨床應(yīng)用

l 全基因組范圍內(nèi)檢測(cè)甲基化位點(diǎn)：

l 研究啟動(dòng)子甲基化對(duì)基因的調(diào)控；

l 比較不同細(xì)胞、組織、腫瘤的甲基化圖譜：

l 尋找疾病診斷和預(yù)后的分子靶點(diǎn)。

標(biāo)本采集、保存、運(yùn)輸

l 基因組DNA樣品，樣品要求：

a樣品純度：OD260／280值應(yīng)在1.7-2.0之間；RIxIA應(yīng)該去除干凈；不得有其它個(gè)體或其它物種的DNA污染；

b樣品濃度：濃度不低于55 ng/ul；

c樣品總量：每個(gè)樣品總量不少于5叫；

d樣品溶劑：溶解在TE中；

e樣品運(yùn)輸：DNA冷凍運(yùn)輸；在運(yùn)輸過程中請(qǐng)將管口密封好，以防出現(xiàn)污染；

l 組織樣品：組織≥100 mg，-80℃保存，冷凍運(yùn)輸；

l 血液樣品：全血≥1.0 ml，-80℃保存，冷凍運(yùn)輸；

l 細(xì)胞樣品：細(xì)胞數(shù)≥106個(gè)，-800C保存，冷凍運(yùn)輸。

報(bào)告形式

l 實(shí)驗(yàn)文件：主要實(shí)驗(yàn)步驟、DNA質(zhì)檢報(bào)告；

l 實(shí)驗(yàn)圖像：芯片掃描圖：

l 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)：原始數(shù)據(jù)和處理的數(shù)據(jù)（甲基化總表、差異甲基化基因的功能分析、差異甲基化基因的pathway分析、Diffscore篩選、DeltaBeta篩選等）。
        
                               做實(shí)驗(yàn)，掃一掃