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高通量測序服務-染色質(zhì)免疫共沉淀技術(ChIP)
染色質(zhì)免疫共沉淀技術(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的有力工具,通常用于轉(zhuǎn)錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。
服務類別:測序/合成總訪問:1033
最后更新:2016-10-18半年訪問:61
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  • 服務介紹
  • 公司簡介

世和基因--高通量測序服務專家

        

   2016年,世和基因引進HiSeq X “超級” 測序平臺,致力于成為全球領先的基因組學研究解決方案提供者,專注于動植物生命科學,臨床轉(zhuǎn)化醫(yī)學,人類健康,及藥物研發(fā)等領域的開發(fā)應用。現(xiàn)在公司高通量測序平臺包括 10 臺 HiSeq X、HiSeq 4000、MiSeq、NextSeq 500等平臺,可滿足臨床診療業(yè)務及科研業(yè)務不同需求,是基因組學的首選合作伙伴。HiSeq X Ten是Illumina公司推出的最高通量,最高效率,最低成本的測序系統(tǒng),首次實現(xiàn)了將人類基因組重測序成本降低到了1000美金以下。HiSeq X Ten由10臺超高通量測序儀HiSeq X組成,系統(tǒng)單臺儀器每次運行可產(chǎn)出高達1.8Tb的數(shù)據(jù),測序讀長為2×150b,運行時間為三天以內(nèi)。10臺儀器同時運行時,每年可完成可超過18000個人類基因組重測序(30×覆蓋度)。因此,HiSeq X Ten系統(tǒng)將使研究人員更易于開展大規(guī)模人類基因組測序,并將有利于深入挖掘與癌癥及復雜疾病相關的遺傳變異。

   染色質(zhì)免疫共沉淀技術(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也稱結合位點分析法,是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的有力工具,通常用于轉(zhuǎn)錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。將ChIP與第二代測序技術相結合的ChIP-Seq技術,能夠高效地在全基因組范圍內(nèi)檢測與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA區(qū)段。

ChIP-Seq的原理是:首先通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(ChIP)特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段,并對其進行純化與文庫構建;然后對富集得到的DNA片段進行高通量測序。研究人員通過將獲得的數(shù)百萬條序列標簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA區(qū)段信息。ChIP-Seq通過對不同表型組織內(nèi)組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子的靶基因表達水平的差異,揭示差異化表觀遺傳變異原理。

   

服務相關-樣品要求:

樣品類型

染色質(zhì)免疫沉淀DNA樣本。

樣品量

100 ng以上

樣品質(zhì)量

OD260/280值在1.8~2.2之間,濃度≥10 ng/μl,DNA片段分布在100~500 bp范圍,且主要片段在250bp附近。

樣品保存

溶于TE或者雙蒸水,樣品必須注明溶劑成分.

樣品運輸

樣品置于1.5 mL管中,封口膜封好,低溫寄送樣品或干冰郵寄。

 

生物信息學分析內(nèi)容

  1. 數(shù)據(jù)質(zhì)量評估與過濾
  2. 基因預測
  3. 基因表達分析
  4. 基因功能注釋
  5. 差異性表達分析
  6. GO功能分析和KEGG代謝通路分析

 

公司簡介:

世和基因是癌癥個體化醫(yī)療診斷及高通量測序行業(yè)的先行者與領航者,2008年末一批在生物醫(yī)藥領域有突出貢獻的北美華人科學家開始致力于高通量全景癌癥基因測序的研究。世和基因生物技術團隊由多名多倫多大學,哈佛大學,斯坦福大學,新加坡國立大學,北京大學及NIH博士和專家組成,專注于高通量測序、癌癥生物學、生物信息學領域并擁有豐富的分子遺傳研究及臨床轉(zhuǎn)化經(jīng)驗。 世和基因依托雄厚的技術實力與世界頂級綜合性醫(yī)院、大學、研究所攜手生命科學領域研究,共同推進基礎研究向臨床成果轉(zhuǎn)化。同時,世和基因科研團隊在科研立項、投稿、溝通、修改上處于國際領先水平,至今已發(fā)表高影響因子文獻(20分以上)近10篇,并擁有數(shù)項核心專利。

 

世和優(yōu)勢:

1. 嚴格的質(zhì)量把控

世和基因的測序流程在符合國際標準的臨床實驗室開展,執(zhí)行最嚴格的質(zhì)量監(jiān)控,完善的實驗流程管理,智能化LIMS報告系統(tǒng)。

2. 高穩(wěn)定的數(shù)據(jù)輸出

使用illumina原廠進口測序試劑,配備了高通量測序所需的全套分子生物學設備。世和基因在堿基準確度、測序均一性、可用數(shù)據(jù)比例等方面的質(zhì)量標準均全球遙遙領先。我們不僅承諾lane/flow cell/run 的總數(shù)據(jù)量,還承諾測序數(shù)據(jù)的Q30。

 3. 多樣化的測序平臺

世和基因擁有HiSeq X, HiSeq 4000, MiSeq, NextSeq 500等測序儀,多種測序平臺保證了項目的快速進行及靈活性。

4. 強大的技術支持與生物信息分析團隊

豐富的基因組項目及處理不同樣品的經(jīng)驗,技術支持由國際名校的博士團隊承擔,強大的生物信息團隊可針對不同項目進行深入分析與數(shù)據(jù)挖掘,保證提供最優(yōu)最新最全的解決方案。

5. 價格優(yōu)勢及短周期

世和基因致力于不斷降低顧客的測序成本,縮短測序周期。我們承諾提供優(yōu)于同行的測序價格和測序周期。

 

世和基因中國總部

南京世和基因生物技術有限公司

南京高新技術產(chǎn)業(yè)開發(fā)區(qū)新錦湖路3號-1

中丹生態(tài)生命科學產(chǎn)業(yè)園02棟18樓

郵編:210061

電話: 400-636-2325

信息咨詢: info@geneseeq.com

業(yè)務咨詢: tony.wang@geneseeq.com

合作咨詢: partnership@geneseeq.com

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