相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性(Sequence—related amplified polymorphism,SRAP)是一種新型的基于PCR的標(biāo)記系統(tǒng),為顯性標(biāo)記。
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一.SRAP技術(shù)簡(jiǎn)介
相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性(Sequence—related amplified polymorphism,SRAP)是一種新型的基于PCR的標(biāo)記系統(tǒng),為顯性標(biāo)記,是由美國(guó)加州大學(xué)蔬菜系Li與Quiros博士于2001年在蕓薹屬作物開(kāi)發(fā)出來(lái)。該標(biāo)記通過(guò)獨(dú)特的雙引物設(shè)計(jì)對(duì)基因的ORFs(Open reading frames開(kāi)放閱讀框 )的特定區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增,上游引物長(zhǎng)17bp,對(duì)外顯子區(qū)域進(jìn)行特異擴(kuò)增。下游引物長(zhǎng)18bp,對(duì)內(nèi)含子區(qū)域、啟動(dòng)子區(qū)域進(jìn)行特異擴(kuò)增。因不同個(gè)體以及物種的內(nèi)含子、啟動(dòng)子與間隔區(qū)長(zhǎng)度不同而產(chǎn)生多態(tài)性。該標(biāo)記具有簡(jiǎn)便、高效、產(chǎn)率高、高共顯性、重復(fù)性好、易測(cè)序、便于克隆目標(biāo)片段的特點(diǎn)。目前已成功地應(yīng)用于作物遺傳多樣性分析、遺傳圖譜的構(gòu)建、重要性狀的標(biāo)記以及相關(guān)基因的克隆等方面。
二.SRAP技術(shù)流程:
★ 引物選擇
★ PCR擴(kuò)增
★ PAGE檢測(cè)或瓊脂糖電泳檢測(cè)
★ 數(shù)據(jù)分析或克隆及測(cè)序
★ 序列分析
三.客戶提供:
★ 基因組DNA:
●至少15μL樣品,濃度為50-100ng/μL;
●2%瓊脂糖電泳檢測(cè)有DNA主帶,沒(méi)有降解;
●DNA經(jīng)過(guò)DNA純化試劑盒或磁珠純化;
●DNA需溶解在TE或滅菌的去離子水里;
●DNA溶解后,肉眼看不到雜色;
★ 植物材料: 新鮮組織,葉片采用硅膠干燥后或干冰運(yùn)輸;
★ 動(dòng)物材料: 新鮮組織,無(wú)水乙醇封存低溫運(yùn)輸;