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人外顯子測(cè)序是指利用探針雜交富集全基因組外顯子區(qū)域的DNA序列,通過高通量測(cè)序后進(jìn)行基因組分析的方法。
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人外顯子測(cè)序是指利用探針雜交富集全基因組外顯子區(qū)域的DNA序列,通過高通量測(cè)序后進(jìn)行基因組分析的方法。外顯子測(cè)序主要用于研究編碼蛋白功能變異以及種群進(jìn)化中的遺傳突變的研究。與全基因組重測(cè)序相比,數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性更高,并且更加經(jīng)濟(jì)、高效。
生物信息分析內(nèi)容
1、數(shù)據(jù)質(zhì)控
2、與參考基因組比對(duì)(統(tǒng)計(jì)測(cè)序深度及覆蓋度)
3、SNP/InDel檢測(cè)、注釋及統(tǒng)計(jì)
4、Somatic SNV/InDel檢測(cè)、注釋及統(tǒng)計(jì)(腫瘤成對(duì)樣本)
技術(shù)參數(shù)
樣本類型:基因組DNA
樣本要求:總量≥2 μg,濃度≥20 ng/μL
文庫類型:小片段文庫
測(cè)序策略:HiSeq X ten PE150
測(cè)序深度:50~100X
捕獲平臺(tái):Agilent
項(xiàng)目周期:35個(gè)工作日
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