真菌基因組測(cè)序服務(wù)

真菌基因組測(cè)序主要針對(duì)無(wú)參考序列的物種進(jìn)行測(cè)序，樣品基因組測(cè)序后從頭開(kāi)始組裝。對(duì)于真菌樣品，由于基因組較大且比較復(fù)雜，推薦先對(duì)真菌樣品進(jìn)行初級(jí)組裝，再根據(jù)初級(jí)組裝的結(jié)果進(jìn)行高級(jí)組裝，以提高組裝質(zhì)量。根據(jù)組裝結(jié)果，可預(yù)測(cè)真菌基因組中包含的基因，通過(guò)功能數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)可得到基因的功能注釋信息。真菌基因組測(cè)序在研究植物致病性真菌、生物防治真菌等方面有重要的應(yīng)用。

根據(jù)不同的研究目的與需求，以及不同的組裝程度需求，真菌基因組測(cè)序提供以下兩種產(chǎn)品類型：真菌框架圖、真菌精細(xì)圖。

生物信息分析內(nèi)容

1、數(shù)據(jù)質(zhì)控

2、Denovo組裝

3、基因組組分分析（基因預(yù)測(cè)、重復(fù)序列、非編碼RNA）

4、基因功能注釋（COG、KEGG、NR、GO、Swiss-prot）

5、致病性分析（分泌蛋白預(yù)測(cè)、PHI、細(xì)胞色素P450、CAZy）

6、比較基因組分析（共線性分析、Core-pan分析、進(jìn)化分析）

技術(shù)參數(shù)

送樣要求

樣本類型：基因組DNA

樣本要求：

DNA小片段文庫(kù)：總量≥2 μg，濃度≥50 ng/μL

DNA大片段文庫(kù)：總量≥30 μg，濃度≥100 ng/μL

其他要求：DNA無(wú)降解，無(wú)RNA 、蛋白質(zhì)等雜帶污染

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