|
采用二代測序與三代測序相結(jié)合的策略，快速完成細(xì)菌基因組完成圖的繪制。
|
|||||||||||||||||
| [發(fā)表評論] [本類其他服務(wù)] [本類其他服務(wù)商] | ||||||||||||||||||
| 服務(wù)商： 深圳承啟生物科技有限公司 | 查看該公司所有服務(wù) >> |
細(xì)菌基因組測序主要針對無參考序列的物種進行測序，樣品基因組測序后從頭開始組裝。根據(jù)物種本身的特點和測序深度的不同，最終的組裝結(jié)果會存在一定的差異。對于細(xì)菌樣品，最高可組裝成一條完整的序列。根據(jù)組裝結(jié)果，可預(yù)測細(xì)菌基因組中包含的基因，通過功能數(shù)據(jù)庫比對可得到基因的功能注釋信息。在病原菌的致病性、疾病的預(yù)防和治療等方面有廣泛的應(yīng)用。
根據(jù)不同的研究目的與需求，以及不同的組裝程度需求，細(xì)菌基因組測序提供以下兩種產(chǎn)品類型：細(xì)菌框架圖、細(xì)菌完成圖。
生物信息分析內(nèi)容
1、數(shù)據(jù)質(zhì)控
2、Denovo組裝
3、基因組組分分析（基因島、重復(fù)序列、非編碼RNA、基因預(yù)測、CRISPR、前噬菌體）
4、基因功能注釋（COG、KEGG、NR、GO、Swiss-prot）
5、致病性分析（分泌蛋白預(yù)測、PHI、VFDB、ARDB、CAZy）
6、比較基因組分析（共線性分析、Core-pan分析、進化分析）
技術(shù)參數(shù)
|
產(chǎn)品類型 |
測序平臺 |
建庫策略 |
測序策略 |
指標(biāo) |
項目周期 |
|
細(xì)菌框架圖 |
HiSeq PE150 |
小片段文庫（350bp） |
≥200X
|
初級組裝 |
30個工作日 |
|
細(xì)菌完成圖 |
PacBio為主，與HiSeq等其他平臺結(jié)合 |
小片段文庫（350bp）+ 大片段文庫（10K） |
小片段文庫（350bp）≥100X 大片段文庫（10K）≥100X |
1 contig， 0 gap |
60個工作日 |
樣本類型：基因組DNA
樣本要求：
DNA小片段文庫：總量≥2 μg，濃度≥50 ng/μL
DNA大片段文庫：總量≥30 μg，濃度≥100 ng/μL
其他要求：DNA無降解，無RNA 、蛋白質(zhì)等雜帶污染
深圳承啟生物科技有限公司
電話：0755-26413091
QQ業(yè)務(wù)咨詢：2796053217
網(wǎng)址：http://www.chi-biotech.com
地址：深圳市南山區(qū)泰邦科技大廈15C
- Target-BS技術(shù)揭示糖尿病引發(fā)勃起功能障礙的DNA甲基化調(diào)控機制
- 合成生物學(xué)底盤細(xì)胞之畢赤酵母常用表達(dá)載體及基因改造技術(shù)
- 深度解析CRISPR文庫篩選流程及應(yīng)用案例
- 可溫和條件下高分辨率檢測m6A修飾的新m6A測序方法開發(fā)研究
- AI人工智能在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測、功能預(yù)測及設(shè)計中的作用
- m5C MeRIP-seq等揭示m5C修飾在癌癥耐藥中的關(guān)鍵調(diào)控機制中的應(yīng)用
- ChIP技術(shù)揭示NURR1在前列腺癌從基因轉(zhuǎn)錄到腫瘤進展中的調(diào)控機制
- 兩種轉(zhuǎn)錄因子在介導(dǎo)番茄果實成熟的表觀遺傳調(diào)控中發(fā)揮的關(guān)鍵作用
瀏覽該公司同類服務(wù)
