miRNA測序服務(wù)

miRNA 測序是研究特定組織在特定狀態(tài)下的所有已知miRNA，分析預(yù)測新的miRNA，并對已知 miRNA 和新miRNA進行靶基因預(yù)測。通過對miRNA靶基因注釋及代謝通路分析，將鑒定出的 miRNA與相應(yīng)表型差異關(guān)聯(lián)起來，為研究miRNA對細胞進程的作用及其生物學(xué)影響提供了有力的工具。

生物信息分析內(nèi)容

1、數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計和質(zhì)量評估

2、sRNA在參考基因組上的分布

3、sRNA分類注釋統(tǒng)計

4、堿基偏好性分析

5、基因表達水平分析

6、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測

7、差異miRNA靶基因預(yù)測

8、差異基因篩選及聚類分析

9、差異表達miRNA靶基因GO富集分析

10、差異表達miRNA靶基因Pathway富集分析

11、差異表達miRNA靶基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析

技術(shù)參數(shù)

樣本類型：total RNA

樣本要求：總量≥3 μg，濃度≥200 ng/μL

文庫類型：Small RNA文庫

測序策略：HiSeq SE50，推薦數(shù)據(jù)量：≥10M reads

項目周期：35個工作日

結(jié)果示例

樣本已知miRNA各位置堿基偏好性

新miRNA二級結(jié)構(gòu)及reads mapping示意圖

各個樣本之間共有novel miRNA分布

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