|
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可全面快速地獲得某一物種特定細(xì)胞或組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有的轉(zhuǎn)錄本及基因序列，可以用于研究基因結(jié)構(gòu)和基因功能、可變剪接和新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)等。
|
|||||||||||||||||
| [發(fā)表評(píng)論] [本類其他服務(wù)] [本類其他服務(wù)商] | ||||||||||||||||||
| 服務(wù)商： 深圳承啟生物科技有限公司 | 查看該公司所有服務(wù) >> |
轉(zhuǎn)錄組是對(duì)特定組織或者特定細(xì)胞在某個(gè)時(shí)期轉(zhuǎn)錄出來的所有mRNA進(jìn)行測(cè)序。從整體水平研究基因功能以及基因結(jié)構(gòu)，全面快速地獲得mRNA序列。已廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領(lǐng)域。
生物信息分析內(nèi)容
|
分析內(nèi)容 |
數(shù)字基因表達(dá)譜（DGE） |
真核轉(zhuǎn)錄組 |
原核轉(zhuǎn)錄組 |
||
|
有參考序列 |
無參考序列 |
有參考序列 |
無參考序列 |
||
|
數(shù)據(jù)質(zhì)控 |
√ |
√ |
√ |
√ |
√ |
|
與參考基因組比對(duì) |
√ |
√ |
|
√ |
|
|
序列組裝（contig、Unigene長(zhǎng)度統(tǒng)計(jì)） |
|
|
√ |
|
√ |
|
基因表達(dá)水平分析 |
√ |
√ |
√ |
√ |
√ |
|
RNA-seq整體質(zhì)量評(píng)估 |
|
√ |
|
√ |
|
|
差異基因篩選及聚類分析 |
√ |
√ |
√ |
√ |
√ |
|
GO/KEGG富集分析（mRNA或非編碼RNA的靶基因） |
√ |
√ |
√ |
√ |
√ |
|
蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析（mRNA或非編碼RNA的靶基因） |
√ |
√ |
|
√ |
|
|
轉(zhuǎn)錄因子注釋（僅對(duì)人和小鼠） |
√ |
√ |
|
|
|
|
SNP/Indel分析 |
|
√ |
|
√ |
|
|
反義轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)(鏈特異性測(cè)序) |
|
√ |
|
√ |
|
|
新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè) |
|
√ |
|
√ |
|
|
可變剪切 |
|
√ |
|
|
|
|
基因功能注釋 |
|
|
√ |
|
√ |
|
ORF預(yù)測(cè) |
|
|
√ |
|
√ |
|
SSR分析 |
|
|
√ |
|
√ |
|
融合基因分析（僅針對(duì)腫瘤樣本） |
|
√ |
|
|
|
技術(shù)參數(shù)
|
|
樣本類型 |
總量&濃度 |
目標(biāo)RNA富集方式 |
文庫類型 |
推薦數(shù)據(jù)量 |
測(cè)序策略 |
項(xiàng)目周期 |
|
數(shù)字基因表達(dá)譜（DGE） |
Total RNA
|
m≥2 μg c≥50 ng/μL |
Olig dT磁珠調(diào)取mRNA |
普通轉(zhuǎn)錄組文庫 |
≥3G clean data |
HiSeq PE150 |
35個(gè)工作日 |
|
真核轉(zhuǎn)錄組 |
m≥2 μg c≥50 ng/μL |
Olig dT磁珠調(diào)取mRNA |
普通轉(zhuǎn)錄組文庫 |
≥8G clean data |
HiSeq PE150 |
35個(gè)工作日 |
|
|
原核轉(zhuǎn)錄組 |
m≥5 μg c≥65 ng/μL |
Ribozero試劑盒去除rRNA |
普通轉(zhuǎn)錄組文庫/鏈特異性文庫 |
≥2G clean data (有參) ≥3G clean data（無參） |
HiSeq PE150 |
35個(gè)工作日 |
結(jié)果示例
深圳承啟生物科技有限公司
電話：0755-26413091
QQ業(yè)務(wù)咨詢：2796053217
網(wǎng)址：http://www.chi-biotech.com
地址：深圳市南山區(qū)泰邦科技大廈15C
- 2025伯豪生物春季全國(guó)巡講開啟，早鳥報(bào)名搶占先機(jī)
- 華大智造副總裁中國(guó)區(qū)總經(jīng)理彭歡歡一行到訪伯豪生物
- 伯豪董事長(zhǎng)出席專精特新中小企業(yè)發(fā)展壯大論壇并發(fā)言
- 伯豪生物雙11狂歡特惠活動(dòng)來襲，限時(shí)限量搶
- 怡美通德推出成本價(jià)體驗(yàn)單細(xì)胞測(cè)序（FFPE或全血）
- 伯豪生物2024系列培訓(xùn)班（陜西站）報(bào)名開啟
- 伯豪單細(xì)胞Flex年中巨惠，1.1W/樣本活動(dòng)價(jià)即將截止
- 藍(lán)景科信DAP-seq技術(shù)相關(guān)文章6連發(fā)，總IF 95.2
- Target-BS技術(shù)揭示糖尿病引發(fā)勃起功能障礙的DNA甲基化調(diào)控機(jī)制
- 合成生物學(xué)底盤細(xì)胞之畢赤酵母常用表達(dá)載體及基因改造技術(shù)
- 深度解析CRISPR文庫篩選流程及應(yīng)用案例
- 可溫和條件下高分辨率檢測(cè)m6A修飾的新m6A測(cè)序方法開發(fā)研究
- AI人工智能在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、功能預(yù)測(cè)及設(shè)計(jì)中的作用
- m5C MeRIP-seq等揭示m5C修飾在癌癥耐藥中的關(guān)鍵調(diào)控機(jī)制中的應(yīng)用
- ChIP技術(shù)揭示NURR1在前列腺癌從基因轉(zhuǎn)錄到腫瘤進(jìn)展中的調(diào)控機(jī)制
- 兩種轉(zhuǎn)錄因子在介導(dǎo)番茄果實(shí)成熟的表觀遺傳調(diào)控中發(fā)揮的關(guān)鍵作用
瀏覽該公司同類服務(wù)
