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翻譯組學主要研究mRNA,tRNA,microRNA,核糖體,新生肽鏈等物質的種類與豐度,動態(tài)與動力學性質,以及它們所擔負的生物學功能。
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翻譯組學主要研究mRNA,tRNA,microRNA,核糖體,新生肽鏈等物質的種類與豐度,動態(tài)與動力學性質,以及它們所擔負的生物學功能。編碼在DNA上的信息要經過轉錄和翻譯,最終生成蛋白質,才能執(zhí)行生物學功能。翻譯控制在生物抗逆、病毒侵襲、腫瘤發(fā)生與發(fā)展等宏觀過程都有著緊密的聯(lián)系。此外,翻譯組學的研究對生化工程、合成生物學等應用科學也具有直接的指導意義。翻譯組學被國際人類蛋白質組計劃(HPP)列為四大支柱之一。
研究方法
mRNA經過轉錄加工為成熟的mRNA后,還需要翻譯為蛋白才能發(fā)揮其功能。翻譯過程中會形成核糖體-新生肽鏈復合物(RNC,Ribosome Nascent-chain Complex),復合物中的mRNA即為能翻譯成蛋白的mRNA。翻譯組測序用超速離心的方法分離出RNC并進一步分離其中的mRNA進行測序,可得到正在翻譯的mRNA信息。
生物信息分析內容
1、數(shù)據(jù)質控
2、基因表達水平分析
3、差異基因篩選
4、GO/KEGG富集分析
5、蛋白互作網絡分析
6、與轉錄組測序或蛋白質組數(shù)據(jù)聯(lián)合分析
7、可視化結果展示
應用方向
1、發(fā)現(xiàn)和鑒定新蛋白
2、蛋白質差異表達分析
3、非編碼RNA(miRNA、LncRNA、cirRNA)作用機制研究
技術參數(shù)
樣本類型:組織或細胞。承啟生物可提供RNC分離及mRNA提取?蛻舨杉瘶颖,需采用公司提供RNC-mRNA測序專用樣本保存液。
測序策略:HiSeq PE150,推薦數(shù)據(jù)量:3G clean data
項目周期:35個工作日
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