多組學(xué)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及數(shù)據(jù)分析系列培訓(xùn)（第二期）

上海市生物信息學(xué)會(huì)（Shanghai Society for Bioinformatics，縮寫(xiě)SSBI）成立于2005年6月，是上海市科學(xué)技術(shù)協(xié)會(huì)下屬的地方性學(xué)術(shù)團(tuán)體，依托單位為上海生物信息技術(shù)研究中心。

 

上海生物信息技術(shù)研究中心在系統(tǒng)建模、定量組學(xué)數(shù)據(jù)獲取、分析、數(shù)據(jù)整合及其相互作用網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù)平臺(tái)建設(shè)方面取得了一系列國(guó)內(nèi)外矚目的研究成果。在此基礎(chǔ)上，近年來(lái)又建立了新一代測(cè)序技術(shù)平臺(tái)，以及依托Thermo Q Exactive、AB QTRAP 4000等儀器的質(zhì)譜技術(shù)平臺(tái)，能夠開(kāi)展基因組、甲基化組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組、代謝組等不同層次的一站式高通量檢測(cè)及數(shù)據(jù)分析。

 

上海市藥物轉(zhuǎn)化工程技術(shù)研究中心成立于2014年，致力于發(fā)展高效、低毒、個(gè)性化腫瘤治療方案和藥物研發(fā)技術(shù)體系，推動(dòng)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的發(fā)展。

 

主辦單位：上海市生物信息學(xué)會(huì)

協(xié)辦單位：上海藥物轉(zhuǎn)化工程技術(shù)研究中心 上海生物信息技術(shù)研究中心 蘇州貝斯派生物科技有限公司 上海麥其知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所

 

會(huì)議地點(diǎn)：上海浦東新區(qū)科苑路1300號(hào)浦東國(guó)際人才城2樓智音廳（曙光醫(yī)院對(duì)面）

 

開(kāi)班時(shí)間：11月12日（周四）-11月14日（周六）

 

 

日期	課程名稱	課程內(nèi)容	時(shí)間
11月12日 （星期四）	報(bào)道-開(kāi)班儀式	生物信息中心介紹	8:30-9:00
	蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及數(shù)據(jù)分析	蛋白質(zhì)組學(xué)—樣本處理和實(shí)驗(yàn)方法 蛋白質(zhì)組學(xué)的方法和進(jìn)展 蛋白質(zhì)組學(xué)—搜庫(kù)及差異蛋白篩選 （Maxquant上機(jī)操作）	9:00-12:00
	代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及數(shù)據(jù)分析	代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及樣本處理 代謝組學(xué)數(shù)據(jù)處理－多維統(tǒng)計(jì)分析（SIMCA-P上機(jī)操作）	13:30-17:00
11月13日 （星期五）	轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析	有referecnce轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 無(wú)reference轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 轉(zhuǎn)錄組高級(jí)數(shù)據(jù)分析（聚類、網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建等）	9:00-12:00
	蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能分析	蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與變異分析 分子對(duì)接與虛擬篩選	13:30-15:00
	多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析	多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析案例	15:45-16:30
	參觀、合影	參觀上海生物信息技術(shù)研究中心	16:30-17:00
11月14日 （星期六）	組學(xué)分析常用軟件上機(jī)練習(xí)	GO和KEGG注釋分析,熱圖繪制與聚類分析、ROC分析等常用方法Cytoscape、Mev、 HemI、STRING、DAVID、KOBAS等軟件使用	9:00-12:00
	科研工作中的專利挖掘和專利保護(hù)		13:30-16:00

注：1.課程具體安排以報(bào)名當(dāng)天的課程表為準(zhǔn)；

2.因需上機(jī)練習(xí)，請(qǐng)自帶筆記本電腦，默認(rèn)是windows系統(tǒng)，若安裝的是linux或蘋(píng)果iOS請(qǐng)自行下載上機(jī)軟件。

 

1.      吳謙博士，副研究員，上海生物信息技術(shù)研究中心質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人。本科、碩士畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系，博士畢業(yè)于上海交通大學(xué)藥學(xué)院。從事質(zhì)譜研究與開(kāi)發(fā)十余年，曾在某知名上市藥企從事新藥研發(fā)工作，參與十余個(gè)一類新藥項(xiàng)目及部分重組蛋白藥物研發(fā)。主要研究方向?yàn)榈鞍踪|(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)及質(zhì)譜定量分析新方法開(kāi)發(fā)，發(fā)表論文10余篇，在基于LC-MS技術(shù)的代謝組學(xué)特別是脂質(zhì)組學(xué)檢測(cè)實(shí)驗(yàn)與分析方面具有豐富經(jīng)驗(yàn)。

 

2.      庫(kù)鑫博士，上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院講師。本科畢業(yè)于華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院，碩士畢業(yè)于中科院上海藥物研究所，博士畢業(yè)于德國(guó)慕尼黑工業(yè)大學(xué)（Technische Universität München）生物分析與蛋白質(zhì)組學(xué)研究所（Prof. Bernhard Kuster）。長(zhǎng)期從事腫瘤蛋白質(zhì)組學(xué)的相關(guān)研究，在國(guó)際期刊上發(fā)表過(guò)多篇相關(guān)論文。目前研究方向?yàn)槟[瘤相關(guān)生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)和蛋白質(zhì)糖基化修飾。

 

3.      李君一博士，中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院系統(tǒng)生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室博士后。本科畢業(yè)于北京大學(xué)物理學(xué)院，碩士畢業(yè)于美國(guó)新澤西州立羅格斯大學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué)系，博士畢業(yè)于羅格斯大學(xué)生物物理專業(yè)。隨后在羅格斯大學(xué)進(jìn)行生物信息學(xué)博士后研究。2013年起在中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院系統(tǒng)生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室繼續(xù)生物信息學(xué)博士后工作。研究方向?yàn)檫\(yùn)用統(tǒng)計(jì)算法及數(shù)理模型，從高通量數(shù)據(jù)出發(fā)，解決遺傳學(xué)和表觀遺傳學(xué)問(wèn)題。近幾年專注于復(fù)雜疾病（如癌癥、糖尿病等）相關(guān)的高通量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析。

 

4.      戴文韜博士，上海生物信息技術(shù)研究中心轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)平臺(tái)生物信息負(fù)責(zé)人。本科畢業(yè)于華東師范大學(xué)生命科學(xué)院，博士畢業(yè)于中科院生物物理所。從事生物信息學(xué)研究多年，利用數(shù)據(jù)挖掘和機(jī)器學(xué)習(xí)方法從事生物大分子模擬分析，組學(xué)數(shù)據(jù)分析挖掘等工作。發(fā)展了進(jìn)行蛋白結(jié)構(gòu)模型質(zhì)量評(píng)估和蛋白相互作用界面預(yù)測(cè)的算法，開(kāi)發(fā)了在國(guó)內(nèi)處于最高精度的蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)服務(wù)器。

 

5.      董紅曼律師，專利代理人，上海麥其知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所的創(chuàng)始合伙人。本科、碩士畢業(yè)于華東師范大學(xué)生物化學(xué)專業(yè)，同時(shí)獲上海交通大學(xué)法律碩士。國(guó)際保護(hù)知識(shí)產(chǎn)權(quán)協(xié)會(huì)、國(guó)際商標(biāo)協(xié)會(huì)、全國(guó)專利代理人協(xié)會(huì)、技術(shù)經(jīng)紀(jì)協(xié)會(huì)會(huì)員。執(zhí)業(yè)領(lǐng)域以知識(shí)產(chǎn)權(quán)法律為主，為海內(nèi)外企業(yè)提供中國(guó)及外國(guó)的專利商標(biāo)事務(wù)，包括申請(qǐng)、復(fù)審、無(wú)效、異議、維權(quán)訴訟，以及商業(yè)并購(gòu)中的技術(shù)轉(zhuǎn)讓許可等法律事務(wù)。

 

6.      李園園博士，研究員，上海生物信息技術(shù)研究中心系統(tǒng)生物學(xué)課題組長(zhǎng)，上海生物醫(yī)學(xué)研究院生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化應(yīng)用中心副主任，上海藥物轉(zhuǎn)化工程技術(shù)研究中心執(zhí)行主任，上海生物信息學(xué)會(huì)理事。本科畢業(yè)于南開(kāi)大學(xué)，碩士畢業(yè)于協(xié)和醫(yī)科大學(xué)腫瘤研究所，博士畢業(yè)于中科院上海生化細(xì)胞所。研究方向?yàn)樯�物信息學(xué)，系統(tǒng)生物學(xué)，轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)。在PLoS Computational Biology、Bioinformatics、Molecular Systems Biology等國(guó)際權(quán)威專業(yè)期刊上發(fā)表論文50余篇，其中第一或通訊作者30余篇。獲軟件著作權(quán)7項(xiàng)，發(fā)明專利授權(quán)3項(xiàng)。擔(dān)任國(guó)家自然科學(xué)基金評(píng)審專家，任PLoS Computational Biology、PLoS ONE、BMC Systems Biology、BMC Bioinformatics、BMC Genomics、Gene、中國(guó)科學(xué)等10余家專業(yè)期刊審稿人。作為項(xiàng)目負(fù)責(zé)人承擔(dān)多項(xiàng)國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、973項(xiàng)目、863項(xiàng)目、上海市科委重大項(xiàng)目等。2006年上海市科技啟明星。2013年明治生命科學(xué)獎(jiǎng)。

 

三、費(fèi)用：

會(huì)議費(fèi)用：3500元/人

在校學(xué)生持學(xué)生證： 3000元/人

說(shuō)明：以上費(fèi)用含證書(shū)（上海生物信息學(xué)會(huì)頒發(fā)）、材料、稅金、午餐、茶點(diǎn)

 

如您計(jì)劃參加，可以登錄上海生物信息技術(shù)研究中心網(wǎng)站（http://www.scbit.org）查看詳細(xì)內(nèi)容或登錄科學(xué)網(wǎng)、丁香園等網(wǎng)址查詢或聯(lián)系當(dāng)?shù)嘏嘤?xùn)負(fù)責(zé)人。