前沿速遞--Cell子刊：組學(xué)大神Matthias Mann發(fā)現(xiàn)帕金森標(biāo)志物

目前為止，帕金森�。≒arkinson's disease，簡稱PD）在臨床上仍然沒有可靠的標(biāo)志物！6月21日，Matthias Mann團(tuán)隊(duì)于在Cell reports medicine（預(yù)計(jì)今年IF >15）發(fā)表了名為“Proteome profiling of cerebrospinal fluid reveals biomarker candidates for Parkinson’s disease研究”，利用高可靠、高靈敏度的蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程，對(duì)來自于兩個(gè)獨(dú)立隊(duì)列共超過200名受試者進(jìn)行了微量腦脊液樣本的蛋白譜分析；利用機(jī)器學(xué)習(xí)算法，發(fā)現(xiàn)了PD相關(guān)蛋白表達(dá)特征及潛在標(biāo)志物，同時(shí)進(jìn)一步揭示了PD的病理機(jī)制。



【亮點(diǎn)總結(jié)】：

1. 針對(duì)微量腦脊液樣本：建立了可重復(fù)的、高可靠的基于質(zhì)譜的腦脊液蛋白質(zhì)組分析流程
2. 在超過200個(gè)個(gè)體的腦脊液中鑒定到超過1700個(gè)蛋白質(zhì)
3. 發(fā)現(xiàn)了LRRK2 G2019S突變攜帶者的溶酶體和免疫相關(guān)標(biāo)志物特征
4. 在腦脊液和尿液的整合水平上，分析了PD與LRRK2突變的相關(guān)特征

 
【隊(duì)列及技術(shù)方法】
113對(duì)照　VS　102　PD患者，DIA技術(shù)
【主要結(jié)果】：
4. LRRK2 G2019S突變相關(guān)的腦脊液蛋白質(zhì)組
 
【總結(jié)】

在這項(xiàng)研究中，Mann研究團(tuán)隊(duì)擴(kuò)展了生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)的流程方法，該方法分析了來自兩個(gè)獨(dú)立隊(duì)列的 200 多個(gè) CSF 樣本，并從微量樣本中檢測(cè)到 1,700 多種蛋白質(zhì)。通過機(jī)器學(xué)習(xí)，研究者確定了PD獨(dú)特的蛋白質(zhì)特征，其豐度在 PD 患者與健康對(duì)照組和 LRRK2 G2019S 攜帶者與非攜帶者中發(fā)生了特別變化。該研究表明，基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)是在體液中發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)志物的強(qiáng)大技術(shù)。該研究還提供了潛在的 PD 生物標(biāo)志物以及與 PD 和/或 LRRK2 突變相關(guān)的生物途徑的見解。