在現(xiàn)代生物學(xué)、醫(yī)學(xué)及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)、藥物學(xué)等研究中,隨著功能基因組研究的深入,生物大小分子的生物學(xué)功能研究占具著非常重要的地位;生物大小分子的相互作用分析成為目前分子功能學(xué)研究中不可缺少的重要手段,因此一個好的分子互作研究工具,無疑將對我們的科研起到極大的促進(jìn)作用。
目前研究分子互作的檢測技術(shù)層出不窮,從傳統(tǒng)的終點(diǎn)法ELISA、Co-IP 、Western Blot雜交檢測到近年迅速火熱的實(shí)時無標(biāo)記的分子互作系統(tǒng)如Biacore、 Nicoya 、Fortebio、MST,ITC,這些無標(biāo)記技術(shù)得到的參數(shù)包括ka,kd,KD值或熱力學(xué)等,各不相同,并且眾說紛紜,令人眼花繚亂,到底哪款系統(tǒng)最適合自己,成了大家很頭疼的問題。
上面的這個圖,單從KD值看,這4組分子的相互作用都一樣, 但細(xì)分之后發(fā)現(xiàn)他們的ka,kd值千差萬別 ,而差異就藏在這些之前無法獲取或忽略的數(shù)據(jù)之中;且只有通過這些數(shù)據(jù)的差異才能真正解析分子間的作用機(jī)制的差異,從而闡述生命的機(jī)理,篩選高效藥物,這提示了我們對儀器選購需要關(guān)注的核心點(diǎn) 。
除了檢測參數(shù),老師們可能還希望選購到一款操作簡單,檢測效率高,結(jié)果又精確的分子互作系統(tǒng),但面對這么多品牌該如何選擇呢?今天小編就給大家曬曬市面上幾款主流品牌的分子互作儀,希望幫助之前踏破鐵鞋無覓處的您,今天可以得來全不費(fèi)功夫!
高大上的Biacore分子相互作用分析儀
Biacore分子互作儀是瑞典公司1990開發(fā)的基于SPR技術(shù)的實(shí)時無標(biāo)記分子互作檢測技術(shù),2006年被美國GE以瑞典克朗SEK29億(美元3億9千萬)收購,之后開始大力推廣。該系統(tǒng)以連續(xù)的金膜為檢測介質(zhì),通過基于折射率的SPR角度的改變檢測分子間的反應(yīng), 獲得的參數(shù)包括ka、kd、KD、蛋白濃度等。Biacore的SPR技術(shù)經(jīng)歷了近20年的發(fā)展,已成為無標(biāo)記分子互作檢測技術(shù)的金標(biāo)準(zhǔn),且型號比較豐富,包括 Biacore8K/8K+,BiacoreS200,BiacoreT200,BiacoreX100,BiacoreC,分子量最低檢測限從100Da到無限制不等, 可廣泛用于藥物學(xué)、抗體疫苗篩選、蛋白研究等,但因儀器光路系統(tǒng)相對復(fù)雜,維護(hù)成本比較高,儀器操作復(fù)雜且價格較高,還需要專人維護(hù),目前大多都是平臺或中心實(shí)驗(yàn)室采購。
查看更多關(guān)于該儀器的信息:https://www.gelifesciences.com/en/us/shop/protein-analysis/spr-label-free-analysis/systems
OpenSPR分子相互作用分析儀
OpenSPR來自加拿大Nicoya公司,其依托于加拿大滑鐵盧大學(xué)技術(shù)研究背景及加拿大政府的扶持,于2015年上市,2016年9月進(jìn)入中國;獲得2016年LSIA獎,是被業(yè)界稱為“零技術(shù)門檻”的下一代SPR技術(shù)系統(tǒng)。雖然該產(chǎn)品在中國的知名度沒有GE的Biacore高,但全球的銷量很不錯,目前已有400余臺, 在中國的知名度正在不斷上升,已經(jīng)安裝了幾十臺, 發(fā)表了多篇高影響因子SCI文章,是一個非常有前景的品牌。
該公司的OpenSPR采用革新性的基于納米金顆粒的局域表面等離子體共振技術(shù)(LSPR),區(qū)別于傳統(tǒng)基于金膜、基于折射率的SPR角度改變的檢測,LSPR
通過波長變化檢測分子間相互作用,是實(shí)現(xiàn)了突破“零技術(shù)門檻”的下一代SPR 技術(shù);最大的特點(diǎn)是操作簡單、出結(jié)果速度快、儀器易維護(hù)且檢測不受溫度及緩沖液折射率影響, 可檢測大于90Da以上的分子,還可2~3小時快速完成實(shí)時Co-IP 檢測;檢測參數(shù)包括Ka,kd,KD,EC50、蛋白濃度等;跟過去動輒上百萬元的分子互作儀相比,價格相對比較低,很受實(shí)驗(yàn)室課題組老師的歡迎。2015年只推出單通道個人版,2018年又發(fā)布了新一代的OpenSPR 單雙通道/OpenSPR-XT雙通道高通量升級版,對藥物學(xué) 、蛋白組學(xué)、腫瘤學(xué)、細(xì)胞信號通路、免疫學(xué)等研究都是一個很不錯的工具, 單雙通道的配置適合實(shí)驗(yàn)室購買自己使用,并可做為大型儀器設(shè)備的補(bǔ)充,新上市的高通量版OpenSPR-XT適合儀器平臺使用。
查看更多關(guān)于該儀器的信息: http://www.premedlab.com/molecular-biology-analysis/2017-04-18/258697.html
高通量篩選的生物膜干涉技術(shù)(BLI)

美國ForteBio分子相互作用分析儀是2006年譚洪博士研發(fā)上市的一款技術(shù)系統(tǒng),這個系統(tǒng)從2001年Fortebio公司創(chuàng)辦開始研發(fā),中間經(jīng)過公司幾乎撐不下去,到2004年被安捷倫救活,并在2006年產(chǎn)品研發(fā)成型并開始上市,2012年被PALL 收購,2015年P(guān)ALL又被丹納赫收購; 目前該系統(tǒng)被劃分到美谷分子儀器旗下;其基于生物膜干涉技術(shù)(BLI)的檢測原理,通過膜表面干涉波長相位移動檢測分子之間相互作用,檢測參數(shù)包括ka,kd,KD,傳感器在上海工廠生產(chǎn),目前的型號包括:Octect系列的 RED96e,HTX,RED384,RED96,QKe,K2和BLITZE,實(shí)際分子量檢測大小從2KD~100KD不等。 Fortebio 的優(yōu)勢在于高通量,可同時對96個或384個樣本進(jìn)行快速的初篩 ,但分子量檢測有限,適合抗體疫苗篩選,不太適合小分子藥物或多肽藥物篩選;其與SPR 技術(shù)系統(tǒng)如Biacore 或OpenSPR一起搭配使用更好。
該產(chǎn)品更多詳細(xì)資料查看此鏈接:https://www.fortebio.com/octet-RED96e.html
無需樣本固定的等溫滴定量熱儀

等溫滴定量熱儀目前在市場上的主要品牌為英國馬爾文(Malvern),其采用等溫滴定量熱法( ITC)檢測原理,是近年來發(fā)展起來的一種研究生物熱力學(xué)與生物動力學(xué)的重要方法,它通過高靈敏度、高自動化的微量量熱儀連續(xù)、準(zhǔn)確地監(jiān)測和記錄一個變化過程的量熱曲線,原位、在線和無損傷地同時提供熱力學(xué)和動力學(xué)信息,可獲得動力學(xué)參數(shù)KD,化學(xué)計(jì)量 (n)、焓 (ΔH) 和熵 (ΔS);儀器操作相繁簡不一,一次蛋白用量 10ug以上 ,樣本要求高純度,一些珍貴樣本可能滿足不了要求;其不需要固定配體,對一些結(jié)構(gòu)敏感蛋白的檢測有優(yōu)勢;動力學(xué)參數(shù)只有KD 值,因此無法獲得幾個對藥物學(xué)等非常關(guān)鍵的參數(shù)如ka,kd值,在小分子藥物或抗體藥物研究應(yīng)用中受限;儀器非流動相檢測, 混合樣本檢測受限; 另其可獲得化學(xué)計(jì)量 (n)、焓 (ΔH) 和熵 (ΔS)值,這些參數(shù)對化學(xué)合成及化學(xué)物結(jié)構(gòu)分析比較有用, 所以總體上,等溫滴定儀更適合做化學(xué)合成及化學(xué)物結(jié)構(gòu)研究領(lǐng)域的實(shí)驗(yàn)室。
查該儀器更多信息:
https://www.malvernpanalytical.com.cn/products/product-range/microcal-range/microcal-itc-range
無需樣本固定的微量熱泳動儀
微熱量泳動儀是NanoTemper公司2010年上市的產(chǎn)品,其采用微量熱泳動技術(shù)(MST),分子在微觀的溫度梯度場中的定向運(yùn)動,生物分子結(jié)構(gòu)/構(gòu)象變化會引起其水化層、分子量、電荷的變化,而導(dǎo)致分子在溫度梯度場中的分布改變,通過賴氨酸自發(fā)熒光或本身標(biāo)記的熒光分布改變分析分子間的相互作用以及各種化學(xué)計(jì)量學(xué)參數(shù),包括KD,能量學(xué)ΔG (自由能 ), ΔH (焓) 和ΔS (熵),目前型號包括需要熒光標(biāo)記的NT.115及NT.115 pico 和非熒光標(biāo)記的基于賴氨酸自發(fā)熒光檢測的NT.LableFree及NT.Automated;系統(tǒng)特點(diǎn)是無需配體固定,對一些結(jié)構(gòu)敏感的蛋白檢測比較有優(yōu)勢,而且可直接檢測溶液中標(biāo)記熒光的目標(biāo)蛋白的相互作用,但是需要做很多個濃度梯度才能擬合出KD值,總體樣本需要量較多,雖然有16通道和96通道型號,但其實(shí)每次只能測一組KD值或8組KD值,對高通量篩選類的實(shí)驗(yàn)還存在局限性;熒光標(biāo)記增加實(shí)驗(yàn)復(fù)雜度及成本,檢測沒有ELISA通量高和快,無標(biāo)記的檢測方式因非流動相檢測,要求樣本高純度,不發(fā)光的化合物或小分子藥物檢測受限 ,儀器價格相對比較貴;總體分析,這款儀器更適合做膜蛋白或蛋白結(jié)構(gòu)分析的平臺。
該產(chǎn)品更多信息請查閱如下鏈接:http://www.nanotemper-technologies.com.cn/product/comparison.html
小編總結(jié):
綜上所述系統(tǒng)涉及SPR,LSPR,ITC,MST和BLI技術(shù);毋庸置疑SPR技術(shù)是最為經(jīng)典的分子互作技術(shù),目前市場的主流品牌主要是GE Biacore 和Nicoya ,Biacore采用經(jīng)典的SPR技術(shù),屬于高大上的儀器,比較適合儀器平臺使用;Nicoya采用的是下一代SPR技術(shù),操作簡單且出結(jié)果速度快、配置靈活,既有適合實(shí)驗(yàn)室的也有適合儀器平臺的機(jī)型; ForteBio生物膜干涉技術(shù)通量高但分子量檢測有限,在抗體篩選方面有著比較大的優(yōu)勢,適合抗體研發(fā)企業(yè)或平臺;MST和ITC因不用固定蛋白,在膜蛋白和蛋白結(jié)構(gòu)研究中優(yōu)勢比較明顯, 同時也適合一些化學(xué)研究的平臺。
更多詳情,敬請關(guān)注下回分解!
小編: 分子互作君