賽默飛HRMS1-DIA方案亮相蛋白質組學學術研討會！

瀏覽次數(shù)：8256　發(fā)布日期：2019-5-29　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉載請注明出處

高通量、高準確 | 賽默飛HRMS1-DIA方案驚艷亮相臨床蛋白質組學和糖組學學術研討會！

5月26日，CNHUPO|臨床蛋白質組學和糖組學學術研討會于上海勝利閉幕。此次研討會，諸多蛋白組學和糖組學專家闡述了組學技術在醫(yī)學/臨床研究中的應用，為未來從研究到臨床轉化探討了新的思路，開拓了更加廣闊的應用前景。

北京生命科學研究院邵峰院士

報告題目：Innate immunity to cytosolic LPS：Pyroptosis and beyond

報告主要內容：

大會由復旦大學陸豪杰教授致開幕詞，北京生命科學研究所邵峰院士做了題為“Innate immunity to cytosolic LPS：Pyroptosis and beyond”的報告，明晰了細胞焦亡與傳統(tǒng)細胞凋亡的區(qū)別，闡述了分子免疫機制：Caspase-4/5/11作為胞內LPS的受體，識別LPS的Lipid A部分，進而發(fā)生寡聚化而激活。這些細菌免疫受體活化后，均通過誘導組裝炎癥小體復合物進而激活膜打孔蛋白GSDMD，誘發(fā)細胞焦亡。

復旦大學生物醫(yī)學研究院副院長楊芃原教授

報告題目：疾病糖蛋白質組的定量質譜

報告主要內容：

從質譜技術發(fā)展歷史，到質譜如何幫助蛋白組學研究，再到質譜技術未來向臨床發(fā)展的展望：以MRM為基礎的質譜ELISA技術可以在臨床檢驗中逐步部分取代現(xiàn)有傳統(tǒng)ELISA，特別是檢驗具有群和網絡特征的關鍵蛋白。同時，運用Orbitrap技術的pGlyco 2.0提供給糖蛋白研究者又一有效的定量策略。

國家蛋白質科學中心·北京秦鈞主任

報告題目：胃癌的臨床蛋白組學研究

報告主要內容：

從蛋白質組學應用于臨床所面臨的問題，到未來蛋白質組學走向臨床的前景，秦鈞教授通過一些臨床研究實例，講述了如何在實踐中逐步克服臨床生物樣本、檢測手段等方面的局限性，描繪了蛋白質組學驅動轉化臨床的可行性。尤其是惡性腫瘤化療藥物靶點、免疫治療標志物、治療響應性標志物等，有望應用于臨床伴隨診斷。無論是在探索分子病理方面，抑或是實現(xiàn)臨床早診、治療領域，蛋白質組學都發(fā)揮著越來越重要的作用。蛋白質組學驅動的精準醫(yī)療時代（Proteomics-driven precision medicine）已經被開啟。

同濟大學田志新教授

報告題目：基于糖蛋白質組學的癌癥和癌癥干細胞生物標志物的分析

報告主要內容：

同濟大學田志新教授，做了在肝癌、乳腺癌研究中發(fā)現(xiàn)N-糖蛋白質標志物的報告，結合ZIC-HILIC富集、同位素二甲基標記、pentaHILIC-nESI-MS/MS（HCD，stepped NCEs）、GPseeker定性、GPseekerQuan定量，對HCC HepG2細胞中差異表達N-糖基化在完整水平上進行大規(guī)模位點和結構特異性的分離、鑒定和定量。

西湖大學郭天南教授

西湖大學的郭天南教授介紹了運用DIA技術結合PCT快速樣品前處理技術在臨床大隊列樣本研究中的應用，以及使用Orbitrap技術平臺建立人類多個組織蛋白質組學數(shù)據(jù)庫，為DIA和PRM分析提供便利。

賽默飛HRMS1-DIA方案廣受關注

大會報告中賽默飛應用經理周岳，帶來HRMS1-DIA技術在臨床大樣本蛋白質組學分析中的可行性評價：

經過來自9個國家和地區(qū)的11個實驗室，連續(xù)7天24小時運行，基于HRMS1-DIA工作流表現(xiàn)出長期運行中保持極高的穩(wěn)定性，在不同儀器及實驗室間產生的數(shù)據(jù)也有極佳的重現(xiàn)性以及提供蛋白質組學準確定量結果。HRMS1-DIA工作流可對精準醫(yī)學研究中的大隊列生物樣品進行高通量和深度的蛋白質組定量。

HRMS1-DIA方案優(yōu)勢：

1、相對傳統(tǒng)DIA的二級碎片離子定量，基于超高分辨一級全掃描的HRMS1-DIA定量蛋白和多肽的數(shù)量和準確性都有顯著提高（蛋白鑒定數(shù)目提高10%，CV<10%）

2、在HRMS1-DIA工作流正常運行的狀態(tài)下，全部11個實驗室，平均可以鑒定到超過8000個蛋白（1% protein FDR），定量超過6000個蛋白。

3、在定量準確性方面，在1小時定量6000個蛋白，50000個肽段的超高通量下，HRMS1-DIA工作流提供93%的定量準確性。

4、超高80%的蛋白可以在每天、每個實驗室定量。

賽默飛HRMS1-DIA方案對于蛋白質組學的臨床轉化具有極為廣泛的參考價值，超高的穩(wěn)定性、日間重復性成為臨床研究領域用戶最值得期待的技術。

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