天河二號超級計算機助力AlphaKnockout基因打靶系統(tǒng)

如果說發(fā)生在2016年春天的人機大戰(zhàn)給圍棋界帶來的是一次不小的震動，那么2017年新年，圍棋界頂尖的人類棋手們算得上經(jīng)歷了一次“飛蛾撲火”般的悲壯。有人說阿爾法狗就像一臺永動機，在擁有龐大計算能力的谷歌云端不停地練習，永不停歇。這意味著它每一秒、每一天都在進步。

同樣，對于天河二號超級計算機，相信國人再熟悉不過了。連續(xù)6次蟬聯(lián)全球最快的超級計算機之后，天河二號與神舟、天宮一號、蛟龍?zhí)柍蔀閲�家級名片。天河二號共�?6000個運算節(jié)點，共312萬個計算核心，其雙精度浮點運算峰值速度達到每秒5.49億億次。在高性能計算、云計算和大數(shù)據(jù)等方面，“天河二號”都有著大規(guī)模的應用。

賽業(yè)生物非常榮幸地加入了天河二號不斷擴充的用戶行列并取得重大突破。賽業(yè)生物研發(fā)的“阿爾法鼠”——AlphaKnockout基因打靶專家系統(tǒng)借鑒“阿爾法狗”永不停歇的深度學習機制，并借助強大的天河二號進行大規(guī)模超強度運算，將基因打靶技術制作基因工程鼠的方案設計過程人工智能化。

眾所周知，基因打靶方案的好壞會直接影響基因打靶的效果。以往一個非常熟練的方案設計專家出一份方案需要一到兩個小時，在這過程中，技術人員需要考慮幾十種因素，并且根據(jù)這些因素的重要程度進行平衡。即使是經(jīng)驗豐富的專家，疏漏也在所難免，而且什么方案最優(yōu)，也基本靠經(jīng)驗主觀判斷。而用計算機來實現(xiàn)上述人類的智慧活動則有很大優(yōu)勢。

賽業(yè)生物歷經(jīng)十一年發(fā)展，其獨特優(yōu)勢就是擁有一個由國際頂尖生物技術專家、生物信息學專家和IT技術專家組成的一流團隊，該團隊已成功研發(fā)出全球首款基因載體智慧設計平臺VectorBuilder (www.vectorbuilder.com),且已服務全球數(shù)萬實驗室。賽業(yè)生物的基因打靶專家為生物信息學團隊提供幾十種需要考慮的因素，生物學信息團隊將這幾十種因素當做限制性條件設計計算規(guī)則，IT團隊則借助天河二號的超級計算能力利用人工智能算法進行計算，讓設計方案不斷從局部最優(yōu)向全局最優(yōu)逼近，從而得到最優(yōu)方案。更為可貴的是，賽業(yè)生物在過去幾年成功完成了數(shù)以千例的小鼠和大鼠基因打靶項目，積累了大量可靠的數(shù)據(jù)來訓練我們的人工智能系統(tǒng)，讓系統(tǒng)進行深度學習，以達到系統(tǒng)參數(shù)的最優(yōu)。這一點類似于阿爾法狗大量學習人類棋譜。

憑借豐富的生物技術領域的智能化軟件設計經(jīng)驗和高效的團隊合作，賽業(yè)生物的技術團隊在短短半年間就成功研發(fā)出了人工智能的AlphaKnockout基因打靶專家系統(tǒng)。該系統(tǒng)免費開放以來，已有數(shù)千用戶在上面便捷地獲取了基因打靶設計方案。并且，作為開發(fā)者的賽業(yè)生物承諾永久免費開放使用。

現(xiàn)在，您只需登錄www.alphaknockout.com，輸入需要敲除的基因信息，即可得到設計完善的方案，并且系統(tǒng)會根據(jù)生物信息學算法，提供多至三個方案，并按優(yōu)先次序排序，排第一位的是默認的最優(yōu)方案。在天河二號的強大運算能力和賽業(yè)云端服務器的支持下，整個過程不超過半分鐘。