【網(wǎng)絡(luò)講座】蛋白質(zhì)譜鑒定軟件Mascot 2.6新功能介紹

講座內(nèi)容簡介：

Mascot是Matrix Science公司開發(fā)的蛋白組學(xué)質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析專業(yè)軟件，是目前主流的蛋白質(zhì)譜分析搜索引擎，是蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)軟件。

2016年12月，Mascot server正式發(fā)布了2.6新版本。另外，在剛剛結(jié)束的美國質(zhì)譜年會（ASMS）上，Mascot Server繼續(xù)發(fā)布了2.6.1版本的技術(shù)更新。

以下是本次網(wǎng)絡(luò)講座的課程內(nèi)容及時間安排，機(jī)會只有一次，不要錯過哦��！

講座時間：2017/7/14(周五) 下午3 : 00-4：30

主辦單位：上海康昱盛信息科技有限公司

主講人：李文婷 | 生物信息學(xué)部 | 技術(shù)工程師

本次網(wǎng)絡(luò)課堂圍繞Mascot Server2.6的新功能進(jìn)行詳細(xì)介紹，主要包括以下內(nèi)容：

Search engine

• 去除了原有在采用多數(shù)據(jù)庫聯(lián)合搜庫時，對數(shù)據(jù)庫必須是同一類型的限制，
• 該版本最大的更新是可以綜合利用NIST MSPepSearch進(jìn)行譜圖庫搜索。

報告中一些算法的修改

• Percolator提升到3.0版本，將 Percolator 的計算擴(kuò)展到所有等級。
• 擴(kuò)展了FDR的計算，不僅基于PSM計算FDR，同時可以對Peptide Sequence 數(shù)目進(jìn)行FDR計算。
• 報告¹³C的校正后的質(zhì)量增差

Mascot Daemon的更新 

• 導(dǎo)出和導(dǎo)入工作任務(wù)數(shù)據(jù)庫
• 直接提交搜庫任務(wù)
• 更好地展示狀態(tài)信息
• 搜索任務(wù)連續(xù)運(yùn)行
• 狀態(tài)的樹狀圖信息過濾
• 自動導(dǎo)出XML格式定量結(jié)果
• 更靈活的數(shù)據(jù)導(dǎo)入過濾

Administration

• Perl的“私人化”副本
• Database Manager支持譜圖庫
• 有計劃地刪除過去的緩存文件，釋放磁盤空間
• 從數(shù)據(jù)庫狀態(tài)中提供鏈接用于數(shù)據(jù)庫再壓縮
• 在ms-review 中設(shè)置默認(rèn)展示的列

利用譜圖庫對蛋白鑒定

• 搜庫參數(shù)設(shè)置
• 結(jié)果報告
• 參考數(shù)據(jù)庫
• 打分與統(tǒng)計
• 數(shù)據(jù)庫配置

超精彩實(shí)用的課程內(nèi)容，你是不是已經(jīng)動心了？想來就趕緊報名吧！或者分享給您的好友哦��！

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關(guān)于Mascot

Mascot是針對質(zhì)譜數(shù)據(jù)，利用蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫、譜圖數(shù)據(jù)庫比對檢索的方法來鑒定樣本中蛋白質(zhì)定性、定量以及翻譯后修飾的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)軟件。Mascot可以支持并能夠嵌入目前絕大多數(shù)的質(zhì)譜系統(tǒng)進(jìn)行質(zhì)譜數(shù)據(jù)的分析解讀，包括AB Sciex、Agilent、Bruker、Jeol、Shimadzu、Thermo Scientific、Waters等蛋白質(zhì)譜儀。Mascot Server是質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理的核心軟件，架設(shè)在基于HTTP的網(wǎng)絡(luò)服務(wù)中，可以支持從本地或網(wǎng)上提交任意數(shù)量的譜圖進(jìn)行搜庫鑒定和定量。同時Mascot提供了一個自動化、標(biāo)準(zhǔn)化的數(shù)據(jù)庫上傳管理、數(shù)據(jù)結(jié)果解讀、導(dǎo)出方案。幫助您不但可以構(gòu)建面向各質(zhì)譜儀的數(shù)據(jù)分析平臺，同時可以向整個學(xué)校的用戶提供在線的分析結(jié)果查看和報告輸出服務(wù)。