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轉錄組研究策略及RNA-seq數(shù)據(jù)分析6月專題培訓班通知

瀏覽次數(shù):3502 發(fā)布日期:2014-6-5  來源:本站 本站原創(chuàng),轉載請注明出處
轉錄組研究策略及RNA-seq數(shù)據(jù)分析專題強化培訓班
2014年6月15日-20日,中國·青島 
 
轉錄組研究策略及RNA-seq數(shù)據(jù)分析專題強化培訓班將于2014年06月15日-20日在青島大學國際學術交流中心舉辦。本期培訓班以第二代測序、第三代測序(單分子測序)在轉錄組學中的應用與RNA-seq數(shù)據(jù)分析為主題,精心設計了具有前沿性、實用性和針對性強的理論課程和上機課程。理論課程由擔任國家973計劃(轉錄組方向)首席科學家、國家自然科學基金重點專項負責人于軍、胡松年等多位研究員親自授課,上機課程由實踐經驗豐富的一線科研人員帶領學員親自實踐RNA-seq數(shù)據(jù)分析流程。本班因老師時間的問題一年只舉辦一次,歡迎各領域廣大科研工作者和高校教師及研究生積極報名參加!
 
主辦單位
北京路思達生物信息科技有限公司 
上,|瑜生物科技有限公司
 
承辦單位
上海陳珖文化傳播有限公司
 
培訓時間:2014年6月15日至20日(6月15日報到)
培訓地點:青島大學國際學術交流中心
 
 
課程安排                                                                      
時間
課程內容
學時
講師
06月15日(周日)
全天
報到、注冊
 
 
06月16日(周一)
9:00-12:00
轉錄組學發(fā)展前沿、科研思路及技術路線
3h
于軍
06月16日(周一)
13:30~16:30
動物轉錄組項目研究講解
3h
于軍
06月17日(周二)
9:00-12:00
二代測序、三代測序在轉錄組學研究中的應用
3h
胡松年
06月17日(周二)
13:30~16:30
植物轉錄組、微生物轉錄組項目研究講解
3h
胡松年
 
06月18日(周三)
9:00-12:00
二/三代測序儀原理介紹
轉錄組建庫實驗流程詳解(包括文庫選擇,測序文庫構建注意事項)
測序文庫試劑的選擇和使用心得等
3h
中科院專家
06月18日(周三)
13:30~16:30
轉錄組數(shù)據(jù)分析概述與經驗交流
(1)介紹轉錄組數(shù)據(jù)分析的整體流程:包括de novo轉錄組分析、有基因組reference的轉錄組分析、microRNA分析等。
(2)轉錄組分析經驗交流:包括測序量如何選擇;測序質量如何評估;如何根據(jù)自己的實際情況選擇mapping/denovo assembly軟件;如何從轉錄組數(shù)據(jù)尋找生物學問題。
Linux常用基本命令
R語言應用簡介
3h(上機)
中科院專家
06月19日(周四)
9:00-12:00
轉錄組denovo(無參考序列)測序數(shù)據(jù)拼接及分析:
利用trinity實現(xiàn)轉錄組denovo組裝,并進行預測蛋白序列、篩選差異基因及計算表達量等功能分析的講解。
3h(上機)
中科院專家
06月19日(周四)
13:30~16:30
基于二代RNA-seq的差異基因分析(參照序列):
主要利用tophat和cufflinks,cuffdiff以及cummeRbund 等工具,實現(xiàn)reads的mapping, 轉錄本的重構,轉錄本的表達量計算,差異基因分析以及利用cummeRbund圖形化展示cuffdiff的分析結果。GO、KEGG富集等功能分析。
3h(上機)
中科院專家
06月20日(周五)
9:00-12:00
miRNA二代測序數(shù)據(jù)分析
1. miRNA數(shù)據(jù)mapping的原理介紹及軟件使用
2. 靶基因預測原理介紹及軟件使用
3. miRNA數(shù)據(jù)庫介紹及使用
4. miRNA的功能分析
3h(上機)
中科院專家
 
相關事項:
A:注冊費                                                                         
3600元/人(含培訓費、上機費、電子版資料費,培訓結束后免費贈送價值1600元的生物信息云平臺使用權限(免費開放2周,培訓后可繼續(xù)進行鞏固練習))。
 
優(yōu)惠政策:
1.5月28日前匯款,注冊費可優(yōu)惠至3400元/人。
2.同一單位三人及以上同時報名注冊費優(yōu)惠至:3300元/人。
3.以上兩種優(yōu)惠不可同時使用。
 
外地學員住宿統(tǒng)一安排在青島大學國際學術交流中心,住宿費用自理。酒店標準間價格:300元/間/天,與其他學員合住標準間價格:150元/間/天,合住按報到先后順序安排,最后出現(xiàn)單數(shù)無法安排情況房間差價費用自理。
6月16日至6月20日會務組為學員提供免費工作午餐,培訓期間早餐及晚餐自理。  
 
B:付款信息(電匯或轉賬)                                                        
賬戶名稱:北京路思達生物信息科技有限公司
賬戶號:321230100100073558
開戶行:興業(yè)銀行海淀支行
轉賬或者匯款時請仔細核對賬戶名稱及賬號,并在匯款用途處注明:姓名
 
C:聯(lián)系方式                                                                        
金老師
TEL: 15021364017
E-mail:zdyy620@163.com  QQ:348280957
名額有限,按學員付款先后順序安排上課及上機位置。上機實踐需自帶筆記本電腦,電腦對系統(tǒng)及配置無特殊要求。
 
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