NimbleGen SeqCap被用于加拿大大型外顯子組測(cè)序項(xiàng)目
羅氏NimbleGen SeqCap用于加拿大一4000外顯子組測(cè)序項(xiàng)目
最近羅氏NimbleGen的SeqCap EZ Exome產(chǎn)品被加拿大多倫多一醫(yī)院基因組服務(wù)中心選中，用于一個(gè)癌癥生物標(biāo)記物研究。該中心將開展一項(xiàng)4000個(gè)外顯子組測(cè)序項(xiàng)目，用于發(fā)現(xiàn)癌癥相關(guān)的生物標(biāo)記物。第一批購(gòu)買的產(chǎn)品還包括一臺(tái)Caliper Sciclone NGS Workstation移液工作站，這個(gè)平臺(tái)將自動(dòng)化、高通量地完成外顯子組序列捕獲，以及二代測(cè)序文庫(kù)制備。該實(shí)驗(yàn)室希望通過建立這一SeqCap EZ Exome與二代測(cè)序結(jié)合的平臺(tái)，加強(qiáng)其在轉(zhuǎn)化基因組方面(translational genomics)的優(yōu)勢(shì)。除該項(xiàng)目外，該平臺(tái)還為Mount Sinai醫(yī)院的其他基礎(chǔ)研究實(shí)驗(yàn)室以及臨床病理實(shí)驗(yàn)室提供多種基因組研究服務(wù)。
NimbleGen的SeqCap產(chǎn)品獲選用于大型外顯子組測(cè)序項(xiàng)目已經(jīng)不是第一次。去年年末SeqCap就被選中運(yùn)用于一項(xiàng)在荷蘭進(jìn)行的大規(guī)模流行病研究項(xiàng)目(Rotterdam Study)，對(duì)超過3000個(gè)樣本進(jìn)行外顯子組捕獲，然后用于測(cè)序。今年年初，在英國(guó)又再次被選中用于一個(gè)血液病相關(guān)研究，對(duì)50000個(gè)樣本進(jìn)行外顯子組捕獲。
此次作為其后續(xù)實(shí)驗(yàn)，對(duì)外顯子進(jìn)行重測(cè)序。實(shí)驗(yàn)中NimbleGen SeqCap液相外顯子捕獲產(chǎn)品(NimbleGen SeqCap EZ Exome Library)以及Caliper Life Sciences的自動(dòng)化平臺(tái)(Sciclone NGS Workstation)將在未來的3-4個(gè)月內(nèi)完成3000多個(gè)樣本捕獲然后進(jìn)行測(cè)序。
多次的成功獲選表明NimbleGen的SeqCap產(chǎn)品 展現(xiàn)了其在市場(chǎng)上的重要地位，同時(shí)體現(xiàn)了NimbleGen高于對(duì)手的性能優(yōu)勢(shì)。同時(shí)，多個(gè)獨(dú)立進(jìn)行的序列捕獲產(chǎn)品比較實(shí)驗(yàn)，也發(fā)現(xiàn)了NimbleGen SeqCap EZ Exome產(chǎn)品的高定向捕獲能力 以及高捕獲均一性，減少了后續(xù)所需測(cè)序量。
同時(shí)， NimbleGen SeqCap EZ成熟的自動(dòng)化解決方案也實(shí)現(xiàn)對(duì)大量樣本的平行、快速、高效的序列捕獲，減少人力和縮短實(shí)驗(yàn)周期，同時(shí)保證實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性、穩(wěn)定性。
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