羅氏 GS Junior 測(cè)序平臺(tái)用于動(dòng)物保護(hù)研究
瀏覽次數(shù):2157 發(fā)布日期:2012-3-9
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GS Junior測(cè)序平臺(tái)用于動(dòng)物保護(hù)研究
羅氏新近與美國(guó)一國(guó)家動(dòng)物園進(jìn)行合作,將Roche GS Junior測(cè)序系統(tǒng)投入到隸屬該動(dòng)物園的動(dòng)物保護(hù)及進(jìn)化遺傳學(xué)中心的研究工作中。該中心將依靠二代測(cè)序平臺(tái)的高深度DNA測(cè)序能力,開(kāi)展新的動(dòng)物的疾病耐受性、群體遺傳學(xué)、 分子生態(tài)學(xué)研究。
該動(dòng)物保護(hù)生物研究所研究重點(diǎn)在于深入了解物種、保護(hù)物種、培養(yǎng)物種保護(hù)學(xué)家,尤其在動(dòng)物生態(tài)研究及管理、動(dòng)物健康及繁殖領(lǐng)域有所專長(zhǎng)。研究人員將利用GS Junior測(cè)序系統(tǒng)對(duì)于威脅動(dòng)物繁衍的危險(xiǎn)致病原進(jìn)行研究,項(xiàng)目?jī)?nèi)容包括:
- 獲得Chytrid Fungus的基因組圖譜,這一致死性真菌在全球范圍內(nèi)造成大量?jī)蓷悇?dòng)物死亡
- 完成大象EEHV1(elephant endotheliotropic herpes virus)高致病性病毒株的測(cè)序
- 繪制擴(kuò)散迅速的鳥(niǎo)瘧(avian malaria)病毒的基因組圖譜,是夏威夷鳥(niǎo)類的死亡原因之一
GS Junior通量非常合適微生物基因組的研究,因此正適合上述項(xiàng)目的開(kāi)展,而其長(zhǎng)讀長(zhǎng)的優(yōu)勢(shì)能很好的分辨高度變異的病毒、細(xì)菌基因組,對(duì)于病原體檢測(cè)以及病毒或細(xì)菌的比較基因組研究都非常重要。合作雙方希望通過(guò)這些項(xiàng)目將二代測(cè)序的巨大潛力引入到更多研究及保護(hù)地球各個(gè)物種的領(lǐng)域中,為保護(hù)生態(tài)體系做出貢獻(xiàn)。