研究人員借助羅氏454測(cè)序系統(tǒng)破譯南極冰層宏基因組

 

多年來(lái)，位于德國(guó) Bremerhaven的Alfred Wegener極地與海洋研究所（AWI）的研究人員一直在研究極地和海洋環(huán)境，以加強(qiáng)我們對(duì)海洋-冰-大氣交互作用以及北極和南極的動(dòng)植物王國(guó)的了解�，F(xiàn)在，AWI 的研究人員在Klaus Valentin 和他的同事— 來(lái)自東英格利亞大學(xué)的Thomas Mock 的牽頭下，宣布他們計(jì)劃對(duì)生活在北極海冰里的多種多樣的生物進(jìn)行首次宏基因組學(xué)分析。他們準(zhǔn)備采用在由羅氏旗下的 454生命科學(xué)公司舉辦的10 GB（Gigabase）免費(fèi)測(cè)序項(xiàng)目中獲得的亞軍獎(jiǎng)項(xiàng)的資助下來(lái)完成該項(xiàng)目。宏基因組測(cè)序能幫助研究人員詳細(xì)地查看某個(gè)復(fù)雜樣本里的種系組成和功能多樣性，近年來(lái)454測(cè)序系統(tǒng)已啟用了其中大部分的序列。

 

Alfred Wegener 研究所和東英格利亞大學(xué)在之前實(shí)施的項(xiàng)目中已完成了對(duì)海洋冰藻和細(xì)菌的基因組測(cè)序。此外，他們還測(cè)序了海冰物種及群落的轉(zhuǎn)錄組— 這些研究的目標(biāo)是破譯促使這些物種在基因上適應(yīng)南極極端環(huán)境的活性基因。作為此項(xiàng)新的宏基因組學(xué)研究的一部分，研究人員準(zhǔn)備對(duì)北極冰層中發(fā)現(xiàn)的一整套微生物進(jìn)行分析，希望找到這些微生物中未開(kāi)啟的基因。

 

Valentin 說(shuō)：“為了解基因組中仍在沉睡的基因，我們將同時(shí)對(duì)活性和惰性基因進(jìn)行測(cè)序。如果諸如氣溫、二氧化碳濃度或光照強(qiáng)度等環(huán)境因素在未來(lái)發(fā)生變化，那么了解極地生物群落具備哪些基因潛力來(lái)對(duì)抗氣候變化是很重要的。”

 

過(guò)去幾十年來(lái)，氣候變化已對(duì)北極的生態(tài)系統(tǒng)造成了巨大的影響，包括海冰、森林和凍原。隨著北極氣溫的升高，棲息在北極地區(qū)的植物、動(dòng)物和細(xì)菌種群要么被迫適應(yīng)環(huán)境的變化，要么只能走向毀滅。

 

羅氏454生命科學(xué)公司的總裁兼CEO Chris McLeod說(shuō)：“我們很高興看到454測(cè)序技術(shù)被應(yīng)用于極地生物群落研究的重要領(lǐng)域。他們的研究結(jié)果將有助于更好地了解全球氣候變暖對(duì)兩極地區(qū)的影響�！�

 

【關(guān)于羅氏】
羅氏始創(chuàng)于1896年，總部位于瑞士巴塞爾，在制藥和診斷領(lǐng)域是世界領(lǐng)先的以研發(fā)為基礎(chǔ)的健康事業(yè)公司之一。作為世界上最大的生物科技公司，羅氏提供從早期發(fā)現(xiàn)、預(yù)防、診斷到治療的創(chuàng)新產(chǎn)品與服務(wù)，在諸多領(lǐng)域都做出了突出的貢獻(xiàn)，從而提高了人類的健康水準(zhǔn)和生活質(zhì)量。羅氏是體外診斷領(lǐng)域、抗腫瘤藥品和移植藥品的全球領(lǐng)先者，是病毒學(xué)領(lǐng)域的市場(chǎng)領(lǐng)導(dǎo)者。在其它關(guān)鍵疾病領(lǐng)域如自身免疫性疾病、炎癥、代謝和中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病等同樣表現(xiàn)活躍。2008年，藥品部的銷售額達(dá)360億瑞士法郎，診斷部的銷售額達(dá)97億瑞士法郎。2008年，羅氏在研發(fā)方面的投入超過(guò)了90億瑞士法郎，并與多個(gè)合作伙伴建立了研究與開(kāi)發(fā)的業(yè)務(wù)聯(lián)盟，包括羅氏控股的基因泰克和中外制藥。羅氏集團(tuán)共擁有約8萬(wàn)名員工。如需了解更詳細(xì)的信息，請(qǐng)?jiān)L問(wèn)www.roche-applied-science.com。

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